Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNMTP50135 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNMTP50135 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNMTP50135 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNMTP50135 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNMTP50135 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNMTP50135 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNMTP50135 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNMTP50135 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HNMTP50135 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNMTP50135 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNMTP50135 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HNMTP50135 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HNMTP50135 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNMTP50135 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNMTP50135 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNMTP50135 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNMTP50135 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNMTP50135 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNMTP50135 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNMTP50135 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNMTP50135 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNMTP50135 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNMTP50135 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNMTP50135 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HNMTP50135 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HNMTP50135 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNMTP50135 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNMTP50135 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNMTP50135 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNMTP50135 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNMTP50135 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNMTP50135 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNMTP50135 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNMTP50135 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNMTP50135 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNMTP50135 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNMTP50135 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNMTP50135 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNMTP50135 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNMTP50135 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNMTP50135 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNMTP50135 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNMTP50135 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNMTP50135 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HNMTP50135 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HNMTP50135 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms