Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RARRES1P49788 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms