Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK1P49759 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLK1P49759 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLK1P49759 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLK1P49759 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLK1P49759 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLK1P49759 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLK1P49759 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLK1P49759 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLK1P49759 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLK1P49759 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLK1P49759 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK1P49759 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLK1P49759 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLK1P49759 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLK1P49759 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLK1P49759 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLK1P49759 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLK1P49759 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLK1P49759 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLK1P49759 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms