Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL1P47992 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL1P47992 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL1P47992 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL1P47992 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL1P47992 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL1P47992 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL1P47992 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL1P47992 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL1P47992 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL1P47992 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL1P47992 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL1P47992 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL1P47992 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XCL1P47992 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XCL1P47992 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL1P47992 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms