Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms