Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB2P47870 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms