Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPZBP47756 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms