Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP5P45974 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP5P45974 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP5P45974 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP5P45974 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP5P45974 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP5P45974 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP5P45974 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP5P45974 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP5P45974 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP5P45974 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP5P45974 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP5P45974 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP5P45974 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP5P45974 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP5P45974 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP5P45974 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP5P45974 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP5P45974 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP5P45974 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP5P45974 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP5P45974 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP5P45974 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP5P45974 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP5P45974 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP5P45974 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP5P45974 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP5P45974 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP5P45974 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP5P45974 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP5P45974 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP5P45974 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP5P45974 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP5P45974 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP5P45974 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP5P45974 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP5P45974 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP5P45974 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP5P45974 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP5P45974 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP5P45974 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP5P45974 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP5P45974 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
USP5P45974 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP5P45974 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP5P45974 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP5P45974 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP5P45974 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP5P45974 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP5P45974 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP5P45974 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP5P45974 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
USP5P45974 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP5P45974 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP5P45974 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP5P45974 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP5P45974 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP5P45974 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP5P45974 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP5P45974 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP5P45974 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP5P45974 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP5P45974 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP5P45974 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP5P45974 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP5P45974 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP5P45974 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP5P45974 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP5P45974 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP5P45974 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP5P45974 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP5P45974 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP5P45974 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP5P45974 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP5P45974 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms