Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPD2P43304 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPD2P43304 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPD2P43304 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPD2P43304 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPD2P43304 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPD2P43304 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPD2P43304 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPD2P43304 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPD2P43304 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPD2P43304 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPD2P43304 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPD2P43304 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPD2P43304 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms