Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTGFRP43088 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms