Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL35P42766 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL35P42766 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL35P42766 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL35P42766 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL35P42766 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL35P42766 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL35P42766 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL35P42766 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL35P42766 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL35P42766 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL35P42766 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL35P42766 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL35P42766 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL35P42766 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL35P42766 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL35P42766 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL35P42766 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL35P42766 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL35P42766 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL35P42766 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL35P42766 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms