Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 KAR2YJL034W 2049 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 TUP1YCR084C 2142 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 KCH1YJR054W 1494 nt5.16□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 RPS16BYDL083C 432 nt5.16□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 RMR1YGL250W 726 nt5.16□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 SEC39YLR440C 2130 nt5.16□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 GSP2YOR185C 663 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 FEX1YOR390W 1128 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 FEX2YPL279C 1128 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 MAK3YPR051W 531 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 SUP35YDR172W 2058 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 GMC1YDR506C 1827 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 PSE1YMR308C 3270 nt5.15□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 URA7YBL039C 1740 nt5.14□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 HRR25YPL204W 1485 nt5.14□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 NOP16YER002W 696 nt5.14□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 SUT1YGL162W 900 nt5.14□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 GAT3YLR013W 426 nt5.14□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 TFC7YOR110W 1308 nt5.14□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 MPS3YJL019W 2049 nt5.14□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 TDA7YNL176C 1911 nt5.13□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 DPB2YPR175W 2070 nt5.13□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 YNG2YHR090C 849 nt5.13□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 ARG8YOL140W 1272 nt5.13□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 PGM2YMR105C 1710 nt5.13□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 NPL6YMR091C 1308 nt5.13□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 DOA1YKL213C 2148 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 VID22YLR373C 2706 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 SRG1SRG1 551 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 YJL211CYJL211C 444 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 ATG17YLR423C 1254 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 AFT1YGL071W 2073 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 WTM2YOR229W 1404 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 RRP3YHR065C 1506 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 LAS21YJL062W 2493 nt5.12□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 YAP1802YGR241C 1707 nt5.11□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 ADK2YER170W 678 nt5.11□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 ATG23YLR431C 1362 nt5.11□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 APE1YKL103C 1545 nt5.11□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 RTC5YOR118W 1704 nt5.11□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 SNF11YDR073W 510 nt5.1□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 SKG1YKR100C 1068 nt5.1□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.1□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 NUP116YMR047C 3342 nt5.1□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 SYP1YCR030C 2613 nt5.1□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 GUS1YGL245W 2127 nt5.09□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 REV7YIL139C 738 nt5.09□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 CLF1YLR117C 2064 nt5.09□□□□□ -1.59
SHQ1P40486 SNF3YDL194W 2655 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 PEX19YDL065C 1029 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 COG5YNL051W 1212 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 SLD7YOR060C 774 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YPL199CYPL199C 723 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YPR109WYPR109W 885 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 CLA4YNL298W 2529 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 SSB2YNL209W 1842 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 EUG1YDR518W 1554 nt5.08□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 GIP1YBR045C 1920 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 SDA1YGR245C 2304 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 CNM67YNL225C 1746 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 SPT3YDR392W 1014 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 PCT1YGR202C 1275 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 DCD1YHR144C 939 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 MRPL39YML009C 213 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 SLZ1YNL196C 897 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 PEX29YDR479C 1665 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YTA12YMR089C 2478 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 APC1YNL172W 5247 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 TAF5YBR198C 2397 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 PRM1YNL279W 1986 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 RCK2YLR248W 1833 nt5.07□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 MEC3YLR288C 1425 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 BOP2YLR267W 1713 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YHR182WYHR182W 2358 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YEL045CYEL045C 426 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 TEF4YKL081W 1239 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 MGR2YPL098C 342 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 RAD30YDR419W 1899 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 ATG18YFR021W 1503 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YMR196WYMR196W 3267 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YEF1YEL041W 1488 nt5.06□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.05□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.05□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YJL220WYJL220W 453 nt5.05□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YAR061WYAR061W 204 nt5.05□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 RCL1YOL010W 1104 nt5.05□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 SKI6YGR195W 741 nt5.04□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.04□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 APS1YLR170C 471 nt5.04□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 PUT1YLR142W 1431 nt5.04□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 BUD7YOR299W 2241 nt5.04□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 APL6YGR261C 2430 nt5.04□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 APC4YDR118W 1959 nt5.04□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 RAD28YDR030C 1521 nt5.03□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 CAX4YGR036C 720 nt5.03□□□□□ -1.6
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