Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPAP38571 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPAP38571 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPAP38571 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPAP38571 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPAP38571 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LIPAP38571 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LIPAP38571 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPAP38571 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LIPAP38571 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LIPAP38571 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LIPAP38571 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LIPAP38571 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LIPAP38571 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LIPAP38571 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LIPAP38571 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LIPAP38571 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LIPAP38571 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LIPAP38571 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LIPAP38571 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LIPAP38571 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LIPAP38571 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LIPAP38571 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LIPAP38571 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LIPAP38571 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LIPAP38571 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LIPAP38571 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LIPAP38571 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LIPAP38571 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LIPAP38571 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
LIPAP38571 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
LIPAP38571 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LIPAP38571 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms