Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAL1P37235 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAL1P37235 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAL1P37235 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms