Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACVRL1P37023 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVRL1P37023 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms