Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBRP36941 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBRP36941 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBRP36941 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBRP36941 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBRP36941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBRP36941 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBRP36941 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBRP36941 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBRP36941 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBRP36941 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBRP36941 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBRP36941 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBRP36941 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBRP36941 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBRP36941 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBRP36941 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBRP36941 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBRP36941 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBRP36941 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBRP36941 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBRP36941 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBRP36941 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBRP36941 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBRP36941 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBRP36941 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBRP36941 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBRP36941 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBRP36941 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBRP36941 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBRP36941 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBRP36941 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBRP36941 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBRP36941 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBRP36941 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBRP36941 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBRP36941 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBRP36941 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBRP36941 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBRP36941 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBRP36941 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBRP36941 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBRP36941 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBRP36941 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBRP36941 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBRP36941 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBRP36941 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms