Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.6 ms