Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT9P35527 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT9P35527 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT9P35527 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT9P35527 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT9P35527 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT9P35527 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT9P35527 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT9P35527 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT9P35527 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT9P35527 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT9P35527 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT9P35527 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT9P35527 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT9P35527 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT9P35527 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT9P35527 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT9P35527 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT9P35527 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT9P35527 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT9P35527 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT9P35527 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT9P35527 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT9P35527 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT9P35527 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT9P35527 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT9P35527 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT9P35527 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT9P35527 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT9P35527 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT9P35527 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT9P35527 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT9P35527 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT9P35527 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT9P35527 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT9P35527 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT9P35527 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT9P35527 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT9P35527 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT9P35527 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT9P35527 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT9P35527 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT9P35527 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT9P35527 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT9P35527 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT9P35527 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT9P35527 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms