Protein–RNA interactions for Protein: P31431

SDC4, Syndecan-4, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC4P31431 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDC4P31431 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDC4P31431 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SDC4P31431 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDC4P31431 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDC4P31431 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC4P31431 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC4P31431 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC4P31431 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC4P31431 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC4P31431 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC4P31431 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC4P31431 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC4P31431 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDC4P31431 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDC4P31431 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SDC4P31431 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDC4P31431 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDC4P31431 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDC4P31431 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDC4P31431 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDC4P31431 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDC4P31431 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDC4P31431 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDC4P31431 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDC4P31431 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDC4P31431 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC4P31431 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDC4P31431 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC4P31431 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC4P31431 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC4P31431 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC4P31431 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC4P31431 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC4P31431 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC4P31431 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC4P31431 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDC4P31431 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDC4P31431 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDC4P31431 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDC4P31431 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDC4P31431 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDC4P31431 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDC4P31431 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC4P31431 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms