Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASQ1P31415 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASQ1P31415 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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