Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPS1P31327 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPS1P31327 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPS1P31327 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPS1P31327 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPS1P31327 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPS1P31327 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPS1P31327 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPS1P31327 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPS1P31327 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPS1P31327 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPS1P31327 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPS1P31327 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPS1P31327 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPS1P31327 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPS1P31327 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPS1P31327 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CPS1P31327 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CPS1P31327 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CPS1P31327 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CPS1P31327 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPS1P31327 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CPS1P31327 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPS1P31327 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPS1P31327 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPS1P31327 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPS1P31327 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPS1P31327 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPS1P31327 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPS1P31327 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
CPS1P31327 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPS1P31327 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPS1P31327 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CPS1P31327 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPS1P31327 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPS1P31327 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CPS1P31327 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPS1P31327 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPS1P31327 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CPS1P31327 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPS1P31327 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPS1P31327 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPS1P31327 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPS1P31327 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CPS1P31327 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CPS1P31327 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CPS1P31327 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CPS1P31327 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CPS1P31327 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CPS1P31327 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPS1P31327 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPS1P31327 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPS1P31327 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPS1P31327 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPS1P31327 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPS1P31327 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms