Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA1P29973 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms