Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MARCKSP29966 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCKSP29966 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCKSP29966 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCKSP29966 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms