Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTGFP29279 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTGFP29279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTGFP29279 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTGFP29279 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTGFP29279 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTGFP29279 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTGFP29279 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTGFP29279 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTGFP29279 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTGFP29279 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTGFP29279 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTGFP29279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTGFP29279 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTGFP29279 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTGFP29279 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTGFP29279 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTGFP29279 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTGFP29279 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTGFP29279 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTGFP29279 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTGFP29279 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTGFP29279 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTGFP29279 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTGFP29279 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTGFP29279 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTGFP29279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTGFP29279 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTGFP29279 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTGFP29279 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTGFP29279 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTGFP29279 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTGFP29279 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTGFP29279 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTGFP29279 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTGFP29279 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTGFP29279 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTGFP29279 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTGFP29279 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTGFP29279 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTGFP29279 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTGFP29279 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTGFP29279 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTGFP29279 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTGFP29279 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTGFP29279 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CTGFP29279 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTGFP29279 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTGFP29279 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTGFP29279 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CTGFP29279 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTGFP29279 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTGFP29279 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTGFP29279 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms