Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms