Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA3P26006 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms