Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms