Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB1P19838 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms