Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFEBP19484 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFEBP19484 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFEBP19484 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFEBP19484 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFEBP19484 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFEBP19484 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFEBP19484 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFEBP19484 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFEBP19484 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFEBP19484 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFEBP19484 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFEBP19484 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFEBP19484 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFEBP19484 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFEBP19484 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFEBP19484 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFEBP19484 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFEBP19484 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFEBP19484 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFEBP19484 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFEBP19484 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFEBP19484 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFEBP19484 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms