Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN2P17655 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN2P17655 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms