Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTLA4P16410 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTLA4P16410 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms