Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCK1P16333 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCK1P16333 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCK1P16333 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCK1P16333 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCK1P16333 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCK1P16333 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCK1P16333 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCK1P16333 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCK1P16333 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCK1P16333 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCK1P16333 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCK1P16333 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCK1P16333 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCK1P16333 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCK1P16333 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCK1P16333 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCK1P16333 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCK1P16333 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCK1P16333 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCK1P16333 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCK1P16333 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCK1P16333 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCK1P16333 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCK1P16333 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCK1P16333 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCK1P16333 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCK1P16333 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCK1P16333 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCK1P16333 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCK1P16333 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCK1P16333 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCK1P16333 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCK1P16333 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCK1P16333 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCK1P16333 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCK1P16333 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCK1P16333 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCK1P16333 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms