Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAFP15056 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRAFP15056 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAFP15056 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAFP15056 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAFP15056 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAFP15056 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAFP15056 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAFP15056 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAFP15056 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAFP15056 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAFP15056 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAFP15056 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAFP15056 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRAFP15056 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRAFP15056 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRAFP15056 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRAFP15056 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRAFP15056 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRAFP15056 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRAFP15056 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRAFP15056 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRAFP15056 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRAFP15056 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRAFP15056 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRAFP15056 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRAFP15056 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRAFP15056 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRAFP15056 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRAFP15056 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRAFP15056 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRAFP15056 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRAFP15056 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRAFP15056 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRAFP15056 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRAFP15056 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRAFP15056 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms