Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD8P13378 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms