Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN1P12814 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms