Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB1P11230 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms