Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C8orf89P0DMQ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms