Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CFC1P0CG37 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFC1P0CG37 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFC1P0CG37 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFC1P0CG37 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFC1P0CG37 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFC1P0CG37 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms