Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2BP0C7M4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms