Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VIL1P09327 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VIL1P09327 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VIL1P09327 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VIL1P09327 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIL1P09327 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VIL1P09327 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIL1P09327 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIL1P09327 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIL1P09327 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIL1P09327 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIL1P09327 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIL1P09327 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VIL1P09327 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VIL1P09327 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VIL1P09327 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VIL1P09327 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VIL1P09327 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VIL1P09327 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VIL1P09327 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VIL1P09327 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VIL1P09327 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VIL1P09327 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VIL1P09327 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VIL1P09327 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VIL1P09327 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VIL1P09327 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VIL1P09327 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VIL1P09327 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VIL1P09327 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VIL1P09327 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VIL1P09327 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VIL1P09327 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIL1P09327 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VIL1P09327 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VIL1P09327 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VIL1P09327 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VIL1P09327 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VIL1P09327 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VIL1P09327 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VIL1P09327 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VIL1P09327 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIL1P09327 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIL1P09327 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIL1P09327 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIL1P09327 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIL1P09327 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIL1P09327 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIL1P09327 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIL1P09327 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIL1P09327 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIL1P09327 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIL1P09327 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIL1P09327 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIL1P09327 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIL1P09327 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIL1P09327 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIL1P09327 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIL1P09327 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIL1P09327 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIL1P09327 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIL1P09327 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIL1P09327 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIL1P09327 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIL1P09327 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIL1P09327 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIL1P09327 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIL1P09327 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIL1P09327 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIL1P09327 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VIL1P09327 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIL1P09327 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIL1P09327 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIL1P09327 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIL1P09327 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIL1P09327 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIL1P09327 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIL1P09327 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIL1P09327 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIL1P09327 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIL1P09327 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VIL1P09327 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIL1P09327 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIL1P09327 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIL1P09327 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VIL1P09327 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIL1P09327 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIL1P09327 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIL1P09327 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIL1P09327 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIL1P09327 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIL1P09327 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms