Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGAVP06756 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms