Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTMAP06454 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTMAP06454 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTMAP06454 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PTMAP06454 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTMAP06454 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTMAP06454 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTMAP06454 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTMAP06454 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTMAP06454 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMAP06454 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMAP06454 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMAP06454 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMAP06454 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMAP06454 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMAP06454 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMAP06454 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMAP06454 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMAP06454 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMAP06454 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMAP06454 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMAP06454 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMAP06454 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMAP06454 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMAP06454 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMAP06454 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMAP06454 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMAP06454 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMAP06454 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMAP06454 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMAP06454 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMAP06454 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMAP06454 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMAP06454 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMAP06454 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMAP06454 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMAP06454 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMAP06454 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMAP06454 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMAP06454 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMAP06454 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMAP06454 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms