Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F9P00740 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F9P00740 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F9P00740 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F9P00740 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F9P00740 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
F9P00740 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F9P00740 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F9P00740 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F9P00740 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
F9P00740 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F9P00740 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F9P00740 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F9P00740 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F9P00740 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F9P00740 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F9P00740 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F9P00740 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F9P00740 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F9P00740 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
F9P00740 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
F9P00740 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms