Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHEK2O96017 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms