Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24AO95486 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24AO95486 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms