Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN4O95460 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN4O95460 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN4O95460 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN4O95460 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN4O95460 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN4O95460 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN4O95460 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN4O95460 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN4O95460 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN4O95460 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN4O95460 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN4O95460 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN4O95460 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN4O95460 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN4O95460 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN4O95460 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN4O95460 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN4O95460 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN4O95460 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MATN4O95460 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN4O95460 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN4O95460 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN4O95460 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN4O95460 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN4O95460 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN4O95460 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms