Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRATO95237 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRATO95237 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRATO95237 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRATO95237 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRATO95237 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRATO95237 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRATO95237 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRATO95237 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRATO95237 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRATO95237 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRATO95237 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRATO95237 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRATO95237 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRATO95237 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRATO95237 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRATO95237 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRATO95237 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRATO95237 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRATO95237 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRATO95237 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRATO95237 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRATO95237 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRATO95237 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRATO95237 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRATO95237 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRATO95237 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRATO95237 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRATO95237 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRATO95237 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRATO95237 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRATO95237 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRATO95237 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRATO95237 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRATO95237 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms