Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH8O95206 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms