Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms