Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31AO94979 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31AO94979 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms